交互式剖面图揭示了发育中的胚胎小鼠腹黑OCT图像中的荫藏能源学加拿大pc28在线开奖网站,为先天性短处和腹黑毁伤的赈济提供了新的成见。
商讨东谈主员建筑了一种新的软件器用,它提供了前所未有的功能,不错看到3D图像的里面。它的交互式动态剖面图使他们或者使用光学干系断层扫描(OCT)图像分析从未见过的胚胎小鼠腹黑发育动态。
史蒂文斯理工学院的商讨小组认真东谈主王尚(音译)说:“对腹黑发育的进一步了解不错为赈济先天性腹黑病提供新的临床计谋,这是最常见的出身短处。”“这些成见也为瞎想腹黑病发作后受损腹黑组织再生的改动计谋奠定了基础,从而改善腹黑功能。”
在Optica出书集团的《生物医学光学快报》杂志上,商讨东谈主员描述了他们新的开源软件器用,称为“剪切样条(clipping spline)”。它是一个用户友好的器用,不错在单个剖面图视图中可视化复杂结构,举例在3D中逶迤的管状结构。
“3D成像还是在生物医学中发达了至关遑急的作用,但淌若咱们谈判到期间方面,也即是说,手脚4D图像,咱们还有更多不错学习的,”商讨小构成员、王尚推行室的商讨助理安德烈·福伯特说。“固然咱们用4D OCT数据展示了剪切样条,但它不错用于任何成像神气的体积图像,用于生物学商讨和临床医学应用。”
可视化复杂的3D结构加拿大pc28在线开奖网站
商讨东谈主员在使用4D OCT图像商讨腹黑轮回阶段的胚胎小鼠腹黑发育时,建筑了剪切样条。在这个阶段,心管逶迤和误解,变成一个复杂的体式,结构和血流格式发生了雄壮的变化。
“轮回阶段是腹黑发育的遑急阶段,亦然一系列先天性短处的原因,”王尚说。“咱们对这一阶段发生的动态和进程知之甚少;固然它们不错成像,但独一有限的器用不错可视化和分析它们。”
为了填补这一时刻空缺,商讨东谈主员建筑了一种新的软件器用,不错进行体积剪辑,这是一种在3D图像中删除某些体素以骄矜里面感敬爱敬爱结构的策画顺次。体积剪辑绝顶于用刀切割一个固体物体来稽查里面是什么。然而,在单个剖视图中对复杂结构进行体积剪裁是具有挑战性的,需要仔细界说要保留和删除的体素之间的领域。
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咫尺,体积剪辑最常见的顺次是使用剪辑平面,其操作就像直刀切割。然而,它们浅近的平面几何结构阻止了凹面的产生,遣散了它们在单一视图中皆备骄矜复杂结构的能力。为了克服这些遣散,商讨东谈主员诈欺了一种被称为薄板样条(TPS)的光滑名义,并初次将其应用于体积剪辑。
TPS是一个由一组适度点界说的3D曲面,它以最小曲率与总计适度点相交。这种直不雅和可调度的名义允许用户移动,添加或删除适度点,以交互式地完善其体式和位置,使其符合复杂的结构。此外,由于TPS是使用数学参数界说的,因此不错奉行算法转化,举例移动、诀别或吞并适度点。这有助于运动的4D体积剪辑和动态可视化,如飞越。
商讨东谈主员还优化了策画管谈,使剪切样条成为一种高效、及时的器用,用于生成和调整剖面图视图。
不雅察腹黑的发育
商讨东谈主员使用剪切样条来可视化和分析胚胎小鼠腹黑发育的OCT数据,举例,在712个期间点上追踪心肌动态当先12.8小时的发育。
剪切样条使他们或者在一个视图中同期看到卷曲的心管的多个部分,提供了比往时更大的动态视图。这使他们对胚胎腹黑的生物力学若何参与产生特定的血流格式有了更好的了解。他们还诈欺剪切样条揭示了早期腹黑的流入束是若何吞并变成静脉窦的,静脉窦是一种指引血液投入发育中的腹黑的结构。
王尚说:“看到这些发育进程的发生果然太神奇了,它激勉了新的思法和假定,可能会对哺乳动物腹黑的发育产生遑急的成见。”“商讨和相识生物发育不仅对改善先天性疾病的临床责罚至关遑急,而况亦然好多其他生物医学领域的基础,举例癌症和再生医学。”
商讨东谈主员默示,这种剪切样条还是准备好在生物医学成像领域获取平日应用。他们咫尺专注于建筑诈欺剪切样条的先进图像处理顺次,并应用剪切样条进一步商讨胚胎腹黑发育的能源学和进程。
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